1855年黄河改道后，原东阿县一分为二，黄河东岸包括了现平阴县的东阿镇和洪范池镇，以及东平县的旧县乡、斑鸠店镇，还有银山镇腊山以北的地方；西岸则主要是如今东阿县的中南部。腊山上还保存着当年县长周竹生留下的题词。1941年，为了抗日，东平、东阿、郓城、寿张、汶上这几个县联合成立了昆山县，当时东阿的斑鸠店和银山一带就被划了过去。到了1949年，昆山县改名梁山县，这个地方正式归了梁山县管。 明洪武八年时，东阿县城搬到了谷城，也就是现在平阴县的东阿镇，这个位置一直用到清朝和民国。明代东阿县是归兖州府东平州管的，清朝雍正十二年又改属泰安府。因为河水时常泛滥，县治得往北边挪，县域范围也跟着变。1947年，县城迁到了铜城镇。黄河东边的老县城东阿镇还有旧县、洪范这一片就归平阴县了。 黄河西边那边，原属平阴县的牛角店、旦镇和原属肥城县的傅家岸等村被划进了东阿县；东阿县的西南角还有些村庄划给了阳谷县。县里跟茌平县交界的村子，都是以赵牛河为分界线来划分的。1949年东阿县归了聊城专区，后来又跟着聊城专区划归到了平原省。到了1952年，这里又回到了山东省。 1958年东阿县被撤销了，地方分给了寿张和茌平两个县。好在1961年又把东阿县给恢复了，还把原来的地盘都还给了它。直到2010年，东阿县的顾官屯镇被划到聊城经济开发区去管理，这标志着东阿县的区划又有了新的调整，也是现代化发展的一个标志。