最近上海搞了个大动作，联手测序巨头Illumina，要把阴性样本变成“金矿”，找隐藏的新致病基因。这次是上海寻因生物科技有限公司跟福君基因正式签约，搞“助力临床发现新基因”计划。双方准备把平台、算法跟临床资源整合起来，让那些长期被忽略的阴性结果发挥大作用。福君基因的CEO赵晔跟寻因生物的周在威博士在现场见证了这一幕。上海交通大学的王剑教授还有好几个医院的临床科室代表都来了，给后面的合作打下基础。 你可能会问，“阴性”的样本怎么这么宝贵呢？随着测序成本降下来，基因检测现在挺常见的。可是还是有超过50%的疑似遗传病患者查不出毛病。这些阴性结果看似没结果，其实藏着新机会：有时候两个看起来差不多的病人基因不一样，可能就是新发现的致病基因。 这次活动挺实惠的，“三免一享”：免费给全国常规做基因检测的临床科室用；门槛是至少要提供5个散发病人或3个以上有家族史且之前没查出来的样本；每家单位还能免费拿到2个家系的数据；测序费用也不贵，1500元全外显子测序+高级分析；总共1000个名额先到先得。 周博士说他们的技术路线主要是trio全外显子测序（WES），就是给患者和父母都做WES。捕获大概2个新发突变和5个复合杂合突变。用自己的算法快速过滤掉常见的多态性变异跟良性变异。再结合信号通路、同源结构域比对、小鼠模型还有CNV数据库等进行交叉验证，大概两周就能锁定候选基因。 上海交通大学王剑教授团队在新英格兰医学杂志上发过不少新致病基因成果。他说要是有两个以上独立家系在同一个基因发现新发或复合杂合突变，那这个基因为很可能是新致病基因。参与的人发现候选基因后可以跟王剑教授团队对接免费做功能实验验证。 福君基因有最先进的Illumina X10和NovaSeq6000测序平台，实验室还通过了美国CLIA/CAP认证；寻因生物专注算法能精准识别各种变异。 这次计划的目标就是解决临床痛点：把新致病基因纳入诊断菜单让患者早点得到精准治疗；给医生提供低成本高回报的科研路径帮他们发论文。