虽说东京审判的另一个严重问题，在于未像德国那样把日本的军政集团和相关组织定性为犯罪组织，可即便如此，那731部队在中国犯下的反人类罪，早成了众所周知的历史黑点。事实证明，那些逃脱死刑的日本战犯，在1950年后被美国人逐渐释放，这简直就是在减刑。然而，这些战犯之所以能免于牢狱之灾，原因在于美国对731部队的特殊照顾。美国看中了石井四郎手里的人体实验数据，德特里克堡的专家甚至专门与石井四郎进行合作，还向他支付了25万日元的费用来换取情报。虽然石井四郎明确表示这些数据不会被用作战争罪行的证据，但对于如今世界格局已经发生巨大变化的今天，亚洲仍然无法摆脱东京审判的影响。 而在中国和亚洲其他地区的受害者看来，这种结果完全是对历史正义的亵渎。更让人气愤的是，那些曾积极参与宣传、提供资金和物资支持的日本财阀，以及大政翼赞会成员都逃脱了法律的制裁。令人痛心的是，这种现象一直延续至今。直到现在，日本仍然没有承认二战中的罪行，右翼势力更是试图恢复军国主义。所有这些恶果，都是东京审判遗留下来的结果，正持续影响着亚洲的稳定与和平。