2019年以来，三号线的客流热度有所下降。根据广州地铁的解释，三号线在2025年日均客运量较2024年减少了5%，与2019年相比更是减少了21%。在这种情况下，广州地铁决定在3月14日开始对非高峰时段的运营组织进行调整。调整后的短线车不再从番禺广场折返，而是改到了大石折返。这一变动把非高峰时段“天河客运站/机场北～番禺广场”短线车变成了“天河客运站/机场北～大石”短线车，且高峰时段保持不变。这样一来，原本大石至番禺广场区间的行车间隔就增加了2到3分钟，满载率也由之前的约30%提升到了50%到60%之间。 此次优化是因为市区通达性得到了改善。随着线网规模扩大和换乘站点增多，三号线得到了有效的分流。去年，三号线非高峰期大石至番禺广场区间满载率仅约三成。为了给更多乘客提供便利和提高运营效率，这次调整是必要的措施。随着客流的回升，在体育西路、珠江新城、嘉禾望岗、广州东站、燕塘、天河客运站、车陂南、大石、市桥和龙归等车站的高峰期，还会视情况采取常态化客流管控措施。 市民搭乘地铁时发现非高峰时段“天河客运站/机场北～番禺广场”短线车已经没有了，行车间隔也增加了两三分钟。对于这个变化，广州地铁给出了解释：新线的分流让去年客流量同比回落了5%，优化前非高峰期大石至番禺广场区间满载率仅约三成。广州地铁表示会持续结合客流情况及市民出行需求来优化运营安排。